Как определяется распределение молекулярной массы (ГПХ против ТСА-N)?
За пределами биофармацевтики | Часто задаваемые вопросы о растительных белковых пептидах
Краткий ответ:ГПХ, также называемая гель-хроматографией, разделяет пептиды по размеру и отображает полное распределение молекулярной массы с пиком и диапазоном, в то время как индекс растворимости в ТСА является упрощенным индикатором, основанным на растворимости, показывающим, насколько белок расщеплен на мелкие фрагменты. Эти два теста отвечают на разные вопросы, основаны на разных физических принципах, и их результаты не являются напрямую сопоставимыми.
Что именно измеряют GPC или SEC
Гель-проникающая хроматография, также называемая эксклюзионной хроматографией, пропускает разбавленный раствор пептида через колонку, заполненную пористыми шариками. Крупные молекулы не могут проникнуть в большинство пор и быстро перемещаются по колонке, в то время как мелкие молекулы исследуют поры и элюируются позже. Детектор регистрирует количество элюируемого вещества в каждое время удерживания, а калибровка с использованием стандартов с известной молекулярной массой преобразует время удерживания в кажущуюся молекулярную массу. В результате получается кривая распределения, а не одно число, что является ее главным преимуществом: она показывает, преобладают ли в веществе короткие пептиды или же в нем все еще присутствует хвост из длинных цепей.
Как читается отчет GPC
- Диапазон молекулярной массы- диапазон от самых маленьких до самых крупных видов, присутствующих в значительных количествах.
- Пиковая молекулярная масса- размер верхней границы распределения, описывающий доминирующую популяцию.
- Доля ниже порогового значения- например, процент распределения ниже заявленной молекулярной массы, показатель, наиболее часто используемый в торговых спецификациях.
- Полидисперсность- отношение средневесовой молекулярной массы к среднечисловой молекулярной массе, простой показатель того, насколько широко распределение.
Поскольку ГПХ — это относительный метод, на результат влияют калибровочный стандарт, колонка, подвижная фаза и детектор, поэтому кажущуюся молекулярную массу всегда следует определять вместе с указанным методом.
Что измеряет индекс растворимого азота ТСА?
Трихлоруксусная кислота осаждает крупные неповрежденные белки, оставляя более мелкие фрагменты в растворе. После осаждения и центрифугирования измеряют содержание азота в растворимой фракции, обычно методом Кьельдаля, и выражают его в процентах от общего содержания азота. Высокое значение указывает на то, что большая часть азота находится в небольших, кислоторастворимых фрагментах, что на практике означает, что вещество подверглось интенсивному гидролизу. Это быстрый и недорогой показатель степени гидролиза, который часто используется в качестве упрощенного индикатора растворимости. Однако он не дает распределения: он сообщает только одно агрегатное число и не может сказать, состоит ли растворимая фракция из дипептидов или из средних цепей.
Почему эти два явления нельзя напрямую сравнивать
| Аспект | ГПК или СЭК | Азот, растворимый в ТСА |
|---|---|---|
| Принцип | Разделение по размерам в пористой колонке | Кислотные осадки плюс измерение содержания азота |
| Выход | Полное распределение с указанием пикового значения, диапазона и пороговых значений. | Один процент от общего содержания азота |
| Основа отсечения | Задается колонкой и калибровкой. | Определяется концентрацией кислоты и условиями осаждения. |
Таким образом, эти два метода не являются напрямую сопоставимыми. Показатель растворимости азота в ТСА нельзя преобразовать в диапазон молекулярной массы, а распределение, полученное методом ГПХ, не позволяет предсказать число ТСА, поскольку один метод представляет собой химическое фракционирование, а другой — физическое разделение по размеру, причем каждый из них зависит от своих условий. Если в спецификации требуются оба метода, они должны быть указаны в сертификате как отдельные параметры со своими методами и ограничениями.
Как их использовать вместе
ГПХ используется в качестве эталона, когда речь идет о характеристиках популяции пептидов, например, при проверке соответствия сорта целевому профилю. Индекс растворимости в ТСА (трихлорацетаминовой кислоте) эффективен для рутинного контроля партий, поскольку он быстр и дешев, а также хорошо отслеживает степень гидролиза при стабильном процессе. Распространенный подход заключается в установлении профиля ГПХ для соответствующего сорта, затем в контроле производства с помощью более простого индекса и периодическом подтверждении профиля или после изменения процесса.
Рекомендуемая литература
Для получения более подробной информации см.как измеряется и определяется горечь,Растворимость в холодной воде и прозрачность раствораиПочему коэффициенты пересчета азота различаются в зависимости от источника.